所羅門王也難斷的植物品種鑑定
Oct 18, 2021
眾所周知的故事中，對嬰兒爭執不下的婦人們遇到所羅門王，白刃閃處，馬上斷出生母是誰。但同樣的方法，來到植物可就行不通了。一刀切下，許多品種具有無性繁殖，營養繁殖的特性，恐怕白白便宜了侵權者，讓他捧著一段復長不息的組織回家，正義可就淪喪了。
植物品種鑑定，尤其是商業品種鑑定，並非一項簡單的工作。不同的研究技術相繼對其展開，試圖以經濟可靠的方式贏得聖杯，而其相關的分子生物學層次研究也於上個世紀末陸續啟動。我們將陸續簡介這些相關技術。
其中，擴增片段長度多型性聚合酶鏈鎖反應（ Amplified Fragment Length Polymorphism-Polymerase Chain Reaction，下稱「AFLP」）是一項發展甚早，應用精熟的技術，最早於1990年代即有荷蘭Keygene公司開始研究。其關鍵在於透過選定具有代表性之樣本，尋得最佳引子組合以產生具適當數量且分布均勻之DNA片段進行分析比對。AFLP雖然發源甚早，但對其技術的更新與突破並未在歷史中停滯。Keygene今年（2021）仍陸續獲得包括「基於AFLP的高通量多態性偵測方法」（Method for high-throughput AFLP-based polymorphism detection，下稱「AFLP高通量多態性偵測法」）等等的美國技術專利。
植物品種鑑定，尤其是商業品種鑑定，並非一項簡單的工作。不同的研究技術相繼對其展開，試圖以經濟可靠的方式贏得聖杯，而其相關的分子生物學層次研究也於上個世紀末陸續啟動。我們將陸續簡介這些相關技術。
其中，擴增片段長度多型性聚合酶鏈鎖反應（ Amplified Fragment Length Polymorphism-Polymerase Chain Reaction，下稱「AFLP」）是一項發展甚早，應用精熟的技術，最早於1990年代即有荷蘭Keygene公司開始研究。其關鍵在於透過選定具有代表性之樣本，尋得最佳引子組合以產生具適當數量且分布均勻之DNA片段進行分析比對。AFLP雖然發源甚早，但對其技術的更新與突破並未在歷史中停滯。Keygene今年（2021）仍陸續獲得包括「基於AFLP的高通量多態性偵測方法」（Method for high-throughput AFLP-based polymorphism detection，下稱「AFLP高通量多態性偵測法」）等等的美國技術專利。
US11008615B2圖示例舉
以Keygene自己的話來說，AFLP所以廣泛用於植物育種及其它領域，「歸因於AFLP的一些特徵，其中最重要的是不需現有序列資訊即可以可重現之方式產生大量遺傳標記。而且，選擇性擴增 … 可使擴增片段的數量符合檢測系統的分辨率，與基因組大小或來源無關。」[1]
至於AFLP高通量多態性偵測法，則更進一步結合了對於核酸片段的高通量定序。早期AFLP技術所提供的DNA標記識別，儘管確實具有部分的共顯性，仍在許多面向上受有僅能偵知同型顯性的侷限性。但隨著技術的日新月異，以Keygene包括AFLP高通量多態性偵測法的最新披露技術內容來看，Keygene的新銳技術已著眼於更廣泛的共顯性標誌呈現，意欲進一步擴張其與SNP標誌的結合應用，將使得其運用範圍及精確度更加提升。CIPO
參考資料：
[1]US11008615B2 (2021), col. 2, lines 1-10, “The AFLP technology (Zabeau & Vos, 1993; Vos et al., 1995) has found widespread use in plant breeding and other field since its invention in the early nineties. This is due to several characteristics of AFLP, of which the most important is that no prior sequence information is needed to generate large numbers of genetic markers in a reproducible fashion. In addition, the principle of selective amplification, a cornerstone of AFLP, ensures that the number of amplified fragments can be brought in line with the resolution of the detection system, irrespective of genome size or origin.”
至於AFLP高通量多態性偵測法，則更進一步結合了對於核酸片段的高通量定序。早期AFLP技術所提供的DNA標記識別，儘管確實具有部分的共顯性，仍在許多面向上受有僅能偵知同型顯性的侷限性。但隨著技術的日新月異，以Keygene包括AFLP高通量多態性偵測法的最新披露技術內容來看，Keygene的新銳技術已著眼於更廣泛的共顯性標誌呈現，意欲進一步擴張其與SNP標誌的結合應用，將使得其運用範圍及精確度更加提升。CIPO
參考資料：
[1]US11008615B2 (2021), col. 2, lines 1-10, “The AFLP technology (Zabeau & Vos, 1993; Vos et al., 1995) has found widespread use in plant breeding and other field since its invention in the early nineties. This is due to several characteristics of AFLP, of which the most important is that no prior sequence information is needed to generate large numbers of genetic markers in a reproducible fashion. In addition, the principle of selective amplification, a cornerstone of AFLP, ensures that the number of amplified fragments can be brought in line with the resolution of the detection system, irrespective of genome size or origin.”
